1. 基本信息

徐坤，男，1985年07月生，遗传学博士，西北农林科技大学副教授、博导。主要从事动物基因编辑技术和酵母基因工程技术的开发及应用研究。是最早从事CRISPR基因编辑技术开发的研究者之一，曾独立自主地开发了CRISPR/St3Cas9系统，并应用于哺乳动物和酵母基因编辑；提出了“酵母菌体微胶囊技术”的概念以及蛋白因子在体干扰（ in vivo  protein interference, iPRTi）的免疫敲降策略。

2. 招生和研究方向

招生专业、方向：动物遗传育种与繁殖和动物营养与饲料科学（博士、学硕），畜牧（专硕），动物生物技术方向。

研究方向：动物基因编辑与分子设计育种、酵母基因工程与动物健康养殖；涉及动物基因编辑技术、动物（羊）分子设计育种、微生物（酵母）基因编辑技术、微生物（酵母）菌体胶囊技术、微生物合成生物学等课题。

3. 教学课程和奖励

承担本科生《分子生物学》、《动物生物技术》、《细胞分子生物学实验》、《动物生物化学实验》、《科技英语写作》、《新生研讨课》和研究生《动物基因工程技术》、《动物繁殖理论与生物技术》、《基因编辑原理与技术》、《动物遗传育种进展》、《现代动物育种学》等课程教学任务。陕西首届高校课堂教学创新大赛三等奖，西北农林科技大学青年教师讲课比赛三等奖。

4. 科研项目和成果

累计发表研究论著59篇，其中第一/通讯作者论文32篇（SCI 24篇、中文核心8篇）。申请发明专利16项，其中已授权8项。近五年来，先后主持国家自然科学基金、陕西省重点研发计划、陕西省自然科学基金、中国博士后基金（一等、特等资助）等科研项目10余项，以研究骨干参加转基因生物新品种培育重大专项（负责动物基因编辑平台建设子任务）和深圳市自然科学基金重点项目（负责微生物基因编辑研究任务）各1项。代表性项目和成果如下：

4.1代表性科研项目

[8] 深圳市自然科学基金基础研究重点项目：脑认知功能障碍神经免疫机制研究(基础20220161), 200万元(30万元), 2023.01-2025.12, 在研, 负责微生物基因编辑任务.

[7] 成都中科奥格生物科技有限公司技术开发项目：猪体细胞B4GalNT2/ B4GalNT2-Like基因CRISPR-STOP协同敲除研究, 15万元, 2022.10-2023.10, 在研, 主持.

[6] 成都纳微金生物技术有限公司研究开发项目：毕赤酵母平台菌株多基因编辑改造， 20万元, 2022.06-2023.12, 在研, 主持.

[5] 大禹生物（西安）产业发展研究院研究开发项目：抗菌肽酵母活菌微胶囊技术开发(DYSW2021-023), 10万元, 2021.07-2023.12, 在研, 主持.

[4] 陕西省重点研发计划：重组酵母介导的仔猪肠道黏膜免疫调控技术研究(2021NY-027), 10万元, 2021.01-2022.12, 结题, 主持.

[3] 中国博士后科学基金特等资助：羊绒生长相关lncRNA基因双等位无筛选标记敲除研究(2018T111111), 15万元, 2019.01-2020.12, 结题, 主持.

[2] 转基因生物新品种培育重大专项：CRISPR/Cas9介导的新型双等位无筛选标记转基因技术(2018ZX0801009B)--双等位打靶及“无缝编辑”技术平台的建立子任务, 201万元(37万元), 2018.01-2020.06, 结题, 子任务负责人.

[1] 国家自然科学基金青年项目：CRISPR/Cas9介导HDR-SSA两步法猪IGF2基因“无缝编辑”新技术研究(31702099), 25万元, 2018.01-2020.12, 结题, 主持.

4.2 代表性学术论著（^#同等贡献，*通讯作者）

（1）动物基因编辑技术与分子设计育种方向

[9] Lyu Ming, Sun Yongsen, Yan Nana, Chen Qiang, Wang Xin, Wei Zehui, Zhang Zhiying, Xu Kun*. Efficient CRISPR/Cas9-mediated gene editing in mammalian cells by the novel selectable traffic light reporters. Int J Biol Macromol. 2023 May; 243:124926. (IF="8.0252," 中科院化学1区Top期刊)

[8] 马宝霞, 崔婕妤, 钱泓润, 张潇筠, 杨森, 张骐镜, 韩艺帆, 张智英, 王建刚, 徐坤*.一种新型的CRISPR/Cas9-hLacI双链DNA供体适配基因编辑系统. 生物工程学报. 2023.05. (A类学报)

[7] Ma Lixia, Xing Jiani, Li Qian, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. Development of a universal antibiotic resistance screening reporter for improving efficiency of cytosine and adenine base editing. J Biol Chem. 2022 Jul; 298(7):102103. (IF="5.4853," 西农G2、中科院生物学2区Top期刊)

[6] 张潇筠, 徐坤*, 沈俊岑, 穆璐, 钱泓润, 崔婕妤, 马宝霞, 陈知龙, 张智英, 魏泽辉*. 一种新型提高HDR效率的CRISPR/Cas9-Gal4BD供体适配基因编辑系统. 遗传. 2022, 36(5): 849-60. (A类学报，封面论文)

[5] Ren Chonghua^#, Xu Kun^#, David Jay Sega, Zhang Zhiying*. Strategies for the enrichment and selection of genetically modified cells. Trends Biotechnol. 2019 Jan; 37(1):56-71. (IF="21.9426," 中科院工程技术1区Top期刊)

[4] Li Xinyi, Bai Yichun, Cheng Xinzhen, Peter Girgis Tawfek Kalds, Sun Bing, Wu Yun, Lyu Huijiao, Xu Kun*, Zhang Zhiying*. Efficient SSA-mediated precise genome editing using CRISPR/Cas9. FEBS J. 2018 Sep; 285(18):3362-75. (IF="5.6217," 中科院生物学2区期刊，Editor’s Choice论文)

[3] Shao Simin, Ren Chonghua, Liu Zhongtian, Bai Yichun, Chen Zhilong, Wei Zehui, Wang Xin, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. Enhancing CRISPR/Cas9-mediated homology directed repair in mammalian cells by expressing Saccharomyces cerevisiae Rad52. Int J Biochem Cell Biol. 2017 Nov; 92:43-52. (IF="5.6521," 中科院生物学2区期刊)

[2] Ren Chonghua^#, Xu Kun^#, Liu Zhongtian, Shen Juncen, Han Furong, Chen Zhilong, Zhang Zhiying*. Dual-reporter surrogate systems for efficient enrichment of genetically modified cells. Cell Mol Life Sci. 2015 Jul; 72(14):2763-72. (IF=9.2346, 中科院生物学1区Top期刊)

[1] Xu Kun, Ren Chonghua, Liu Zhongtian, Zhang Tao, Zhang Tingting, Li Duo, Wang Ling, Yan Qiang, Guo Lijun, Shen Juncen, Zhang Zhiying*. Efficient genome engineering in eukaryotes using Cas9 from Streptococcus thermophilus . Cell Mol Life Sci. 2015 Jan; 72(2):383-99. ((IF=9.2346, 中科院生物学1区Top期刊)

（2）酵母基因工程技术与微生物合成学方向

[5] 刘宇飞, 曹颖, 常立业, 单聪慧, 徐坤*. 毕赤酵母细胞工厂工程化改造与应用. 生物工程学报. 生物工程学报. 2023.05. (A类学报)

[4] Yue Feng, Du Lihong, Wang Ruyu, Han Baoquan, Zhang Xiaojun, Yao Zhangzhang, Zhang Wenqiang, Cai Chang, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. In vivo Protein Interference Oral Administration of Recombinant Yeast-Mediated Partial Leptin Reduction for Obesity Control. Front Microbiol. 2022 Jun 14; 13:923656. (IF="6.0644,中科院生物学2区Top期刊)

[3] Hafiz Muhammad Zakria, Han Baoquan, Yue Feng, Mu Lu, Fang Yuanyuan, Li Xiaoyu, Xu Kun*, Zhang Zhiying*. Significant body mass increase by oral administration of a cascade of shIL21-MSTN yeast-based DNA vaccine in mice. Biomed Pharmacother. 2019 Oct; 118:109147. (IF=" 7.4194, 中科院医学2区Top期刊)

[2] Han Baoquan^#, Xu Kun^#,*, Liu Zhongtian, Ge Wei, Shao Simin, Li Pengcheng, Yan Nana, Li Xinyi, Zhang Zhiying*. Oral yeast-based DNA vaccine confers effective protection from Aeromonas hydrophila infection on Carassius auratus. Fish Shellfish Immunol. 2019 Jan; 84:948-54. (IF="4.6224," 中科院农林科学类1区Top期刊)

[1] Luo Zhixin, Wang Shanhe, Jiao Beilei, Yuan Dan, Dai Dongmei, Wang Lixian, Xu Kun*, Wang Xin*. Gene cloning and seamless site-directed mutagenesis using single strand annealing (SSA). Appl Microbiol Biotechnol. 2018 September 12; 102 (23):10119-26. (IF=5.5603, 中科院工程技术2区Top期刊)

（3）专著/丛书章节论文

[3] Zhang Zhiying, Segal David Jay, Xu Kun, eds (2020). Precise Genome Editing Techniques and Applications. Lausanne: Frontiers Media SA. doi: 10.3389/978-2-88963-779-9.

[2] Xing Jiani, Zhang Cunfang, Xu Kun, Hu Linyong, Wang Ling, Zhang Tingting, Ren Chonghua, Zhang Zhiying. An Improved Genome Engineering Method Using Surrogate Reporter-Coupled Suicidal ZFNs. In: Liu J. (eds) Zinc Finger Proteins (Chapter 13). Methods in Molecular Biology (2018), vol 1867. Humana Press, New York, NY.

[1] Xu Kun, Liu Zhongtian, Zhang Long, Zhang Tingting, Zhang Zhiying. SiRNA In Vivo-Targeted Delivery to Murine Dendritic Cells by Oral Administration of Recombinant Yeast. In: Shum K., Rossi J. (eds) SiRNA Delivery Methods (Chapter 14). Methods in Molecular Biology (2016), vol 1364. Humana Press, New York, NY.

4.3 代表性发明专利

[9] 防治柱状黄杆菌感染的口服重组酵母菌株及其制备方法和应用. 徐坤, 姚长长, 张存芳, 刘宇飞, 敖峻珩, 贾劭娜, 宋维杰, 郝佳慧, 蔡伟杰. 申请号CN202310729111.5. 申请日2023/06/19.

[8] 防治杀鲑气单胞菌感染的口服重组酵母菌株及其制备方法和应用. 张存芳, 姚长长,徐坤, 杜丽宏, 张帆, 蔡畅, 郝佳慧, 赵霞芳, 蔡伟杰. 申请号CN202310736721.8. 申请日2023/06/19.

[7] 红绿光切换式交通信号灯基因编辑阳性报告富集系统. 徐坤, 吕明, 张智英, 马宝霞,王旭, 孟祥宇, 李尚朴, 杨森. 申请号CN202310388217.3. 申请日2023/04/12.

[6] 一种口服酵母介导的产气荚膜梭菌α毒素重组DNA疫苗. 徐坤, 杨小军, 张文强, 杜丽宏, 姚长长, 麻啸涛, 朱宇飞, 贾邵娜, 刘宇飞, 蔡畅, 赵霞芳, 汪楚涵, 单聪慧. 申请号CN202310275151.7. 申请日2023/03/20.

[5] 一种用于瘦素免疫调节的口服重组酵母菌株. 张智英, 岳峰, 徐坤, 韩宝泉,王如玉, 张潇筠, 李晓玉, 姚长长. 申请号CN202011262351.1. 申请日期2020/11/12.

[4] 一种增强基因表达的自激活Gal4/UAS系统表达盒的建立. 徐坤；刘玉万；张智英；闫娜娜；雒志新；韩宝泉；李欣憶；张哓兰. ZL 201710381327.1. 授权日期2020/5/19.

[3] 基于人工核酸酶的可视化细胞修复效率报告系统及其建立方法. 张智英, 邵斯旻, 徐坤, 韩芙蓉, 沈俊岑, 白义春. ZL201611020358.6. 授权日期2020/4/21.

[2] 一种利用CRISPR/Cas9技术基于SSA修复的基因无缝编辑方法. 张智英, 白义春, 徐坤, 魏泽辉, 和林洁, 任充华, 邵斯旻, 吴芸, 刘中天. ZL201610333062.3. 授权日期2019/10/11.

[1] 基于CRISPR/Cas9的外源基因敲入整合系统及其建立方法和应用. 张智英, 吴芸, 徐坤, 白义春, 吕慧娇. ZL201610703246.4. 授权日期2019/10/8. 转让日期2021/10/29.

5．联系方式

通讯地址：陕西杨凌西农路22号西农大北校区3344体育在线官网

邮编：712100

Email：xukunas@nwafu.edu.cn, 564737724@qq.com

（更新时间2023.09.01）